🔬 AMR-BERT Konveyeri
(İnkişafda – gözlənilən Q1 2026)
Nextflow, yığılma, QC, CARD və DNABERT2 təsnifatını birləşdirən ucdan-uca AMR proqnozlaşdırma sistemi.
Texnologiya: Python, PyTorch, DNABERT2, ESM2, Nextflow, Docker
🧬 Avtomatik AMR Gen Aşkarlama Konveyeri
(Tamamlanıb)
SPAdes + Prokka + Abricate + xüsusi QC modulları; Docker ilə yerləşdirilmiş və avtomatik hesabatverma.
Texnologiya: SPAdes, Prokka, Abricate, Docker, Python, Bash
🧪 Nextflow WGS Emal İş Axını
(İnkişafda)
Bakterial yığılma, annotasiya, AMR identifikasiya, filogenomika üçün modul DSL2 konveyeri.
Texnologiya: Nextflow, nf-core, Docker, Prokka, FastTree, SNP-sites
🧠 Xam oxumalardan ML Əsaslı Patogen Təsnifatı
(İnkişafda)
Bakterial növləri təsnif etmək üçün k-mer oxunuşları üzərində öyrədilmiş ikili və çox-sinifli modellər.
Texnologiya: PyTorch, scikit-learn, FastAPI